动漫动画制作片面追求“技术含量”
许多教师希望多媒体动画“好玩”一点，“花”一点，“档次”高一点，画面背景复杂，按钮繁多，令人目不暇接。似乎没有众多动画，没有美妙音响，就算不得有水平。这样片面追求“技术含量”的结果，表面看能激发学生的兴趣，实际上往往会分散学生的注意力，使教学效果大打折扣。
每个动画都应当是“量身定造”的，但“量身定造”不等于另起炉灶，我们可以利用各种共享资源，比如市场上出售的各种素材光盘、因特网上浩如烟海的资源、以及其他教师自制的动漫动画等，根据教师各自的要求加以组合，以减少重复劳动。
动漫动画制作在学校正在起步，问题在所难免，只要行政领导高度重视，全体教师积极参与，大家一起来实践研究，必然会看到动漫动画制作带来教育界的又一个春天。
目前，大多数学校只有计算机教师懂计算机，其他任课教师对计算机知之甚微。造成这种状况的原因在于以下方面，一是领导认识有偏差，他们认为有个别懂计算机的教师装点门面就可以了，对计算机发展所引起的教育变革缺乏了解和认识；二是教师对计算机存在恐惧感，或者忙于应付日常教学，懒得为此劳神费心；三是动漫动画制作相对繁琐，现成动画的使用又不能得心应手，损伤了教师利用计算机辅助教学的积极性。
动漫动画制作的创意与制作“脱钩”
最理想的动漫动画制作应是创意与制作都由使用者完成，然而真正懂制作的一线教师太少。目前的动漫动画制作动画往往是由一线教师创意，计算机教师辅助制作，由于彼此在认识与理解上的偏差，制作者往往难以把握，因而实际制作出的动画总是难称创意者的意，其教学效果更是难以令人满意。
动漫动画代替学生的思维与操作
目前的动画大多侧重于教会学生知识，把教材内容中抽象的化为形象的，理性的化为感性的，主要呈现原本需要教师讲解、学生思考和动手操作的东西，不少动画充当的是电子图书的角色，主要目的是通过“图文声并茂”帮助学生理解知识，这跟素质教育思想是大相径庭的。动画应当符合启发性原则，在努力调动学生学习兴趣的前提下，注重培养学生能力，发展学生智力，促使学生积极参与，动脑动手，努力培养学生的创新精神，而不能越俎代庖。